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亲缘关系鉴定

在动物育种过程中,由于人工授精操作不规范、系谱文件缺失、引种记录不全等因素,很多育种企业都面临着群体结构混乱和系谱不完善等问题,这大大影响了企业正常的生产和育种工作。一份准确的系谱信息,对于确保育种群体中优秀原种的真实身份,提高育种值的估计的准确性,实现科学引种、选配和培育优良品种,加快育种遗传进展具有十分重要的意义。通过系统进化树、亲缘关系矩阵和计算PI_HAT值等方法互相验证,对同一品种不同个体的基因分型数据进行亲缘关系分析。

Sample requirements

材料准备            

  •                            

    DNA样品

     总量:

    ≥ 1.0μg

     浓度:

    ≥ 50ng/μL

  •                            

    组织样本

     总量:

    ≥ 100mg(动物),

    ≥ 200mg(植物)

  •                            

    血液样本

     总量:

    ≥ 2mL

Schematic diagram and flow chart

技术示意图及具体流程                

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Credit analysis

结果展示            

  • 系统进化树分析 /                            
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    描述群体内个体间进化顺序的分支图或树,用来表示群体间的进化关系。根据群体的物理或遗传学特征等方面的共同点或差异计算其亲缘关系远近。
  • 亲缘关系矩阵 /                            
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    根据全基因组等位基因频率构建亲缘关系矩阵( Kinshipmatrix);然后,计算亲缘关系矩阵的特征值和特征向量。
  • PI_HAT估算 /    
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    计算亲本与子代之间的PI_HAT值,完全不相关的两个个体,其PI-HAT值=0;具亲子关系的样本,其PI-HAT接近0.5;而重复样本,其PI-HAT值=1。